Шебекинский район расположен в центральной части Русской равнины, на южных склонах Среднерусской возвышенности, в бассейне двух крупных рек Днепра и Дона. Рельеф края однороден, с небольшим понижением к югу. В крае расположены большие залежи высококачественного мела. Над ними располагается слой осадочных пород — глины, мел, мергели и песчаники с включениями кремния, месторождениями фосфоритов и кварца. Большую ценность представляют месторождения руд с высоким содержанием железа. По территории Шебекинского района протекают реки Северский Донец, Нежеголь, Короча и Корень, часть Белгородского водохранилища, построенного в 1985 году, искусственные водоемы — рыбоводческие пруды. Ценные источники минеральных вод находятся в окрестностях сел Маслова Пристань и Муром. Край относится к лесостепной зоне. В районе насчитывается более 1000 видов растительности, причем виды двух различных зон степи и леса вынуждены сосуществовать вместе. Массив Шебекинского леса составляет около 30 тысяч гектаров. Основной породой шебекинских лесов является дуб. Он соседствует с ясенем, вязом, черемухой и другими породами. Хвойные виды представлены сосновыми борами, в том числе реликтовыми меловыми. Животный мир края насчитывает около 6000 видов. Среди самых крупных следует назвать лося, косулю и дикого кабана. В Шебекинском крае располагаются 8 памятников природы, 5 зоологических заказников, один ботанический заказник. Самым известным памятником природы Шебекинского района является ландшафтно-ботанический заказник «Бекарюковский бор». Он располагается около с. Маломихайловка на правом берегу реки Нежеголь. Наибольшую ценность представляет древний реликт сосна меловая. На территории края известны и деревья-долгожители: 500- и 300 — летние дубы, 100-летняя ель. Панский дуб в с.Яблочково Шебекинского района возрастом 550лет выглядит очень живописно. Самое старое дерево Белгородчины, туристическая достопримечательность. Ботанический вид - дуб черешчатый. Дерево растёт у западной окраины села Яблочково Шебекинского района. Высота дуба - 35 метров, обхват - 5,5 метров, размах кроны - 25 метров. В 1968 году учёные-лесоводы определили его возраст - 500 лет. Сейчаc, соответственно, возраст дерева - около 550 лет. Панский дуб включён в список памятников природы Белгородской области, с 2013 года - в список России.